MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA02

Total Repeats: 3722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019439	ACT	2	6	777291	777296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_019439	AAC	2	6	777297	777302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_019439	TAT	2	6	779722	779727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_019439	AAT	2	6	779741	779746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_019439	AAT	2	6	779789	779794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019439	AAT	2	6	779864	779869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_019439	CTT	2	6	780432	780437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_019439	GAA	2	6	780438	780443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_019439	TTG	2	6	780454	780459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_019439	A	7	7	781388	781394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_019439	TC	4	8	781418	781425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_019439	ATTT	2	8	781464	781471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_019439	A	6	6	781508	781513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_019439	TAG	2	6	781578	781583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_019439	TTC	2	6	781936	781941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_019439	TAA	2	6	782377	782382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_019439	ATT	2	6	782434	782439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_019439	ATT	2	6	782521	782526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_019439	ATT	2	6	782535	782540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019439	TTA	2	6	782597	782602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019439	CTA	2	6	782607	782612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_019439	AT	3	6	783903	783908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_019439	CGT	2	6	784034	784039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_019439	A	7	7	784109	784115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_019439	CTA	2	6	784221	784226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_019439	AAC	2	6	785263	785268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_019439	GAT	2	6	785300	785305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_019439	AATT	2	8	785307	785314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_019439	CAGT	2	8	785328	785335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_019439	GCA	2	6	785386	785391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_019439	A	8	8	785394	785401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_019439	GAT	2	6	785435	785440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_019439	GAT	2	6	785453	785458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_019439	CAGG	2	8	785490	785497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_019439	A	6	6	785551	785556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019439	AGT	2	6	785617	785622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_019439	CTC	2	6	785689	785694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_019439	CTT	2	6	785741	785746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_019439	GAG	3	9	787049	787057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_019439	G	6	6	787212	787217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_019439	G	6	6	787220	787225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_019439	ATA	2	6	787254	787259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_019439	AAC	2	6	787267	787272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_019439	CTT	2	6	787316	787321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_019439	TTC	2	6	787324	787329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_019439	TGT	2	6	787354	787359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_019439	TAA	2	6	787384	787389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_019439	A	6	6	787394	787399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_019439	A	6	6	787424	787429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_019439	A	6	6	787434	787439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_019439	G	6	6	788398	788403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_019439	ACC	2	6	788528	788533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_019439	A	6	6	788554	788559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_019439	T	6	6	788564	788569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_019439	AT	3	6	788590	788595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_019439	T	6	6	790618	790623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_019439	ATA	2	6	790646	790651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_019439	AGT	2	6	790701	790706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_019439	C	6	6	790748	790753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3560	NC_019439	GTTT	2	8	791776	791783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_019439	AATCT	2	10	791873	791882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3562	NC_019439	T	7	7	792672	792678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_019439	CAT	2	6	792808	792813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_019439	CCT	2	6	792832	792837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_019439	ACA	2	6	793660	793665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_019439	ATT	2	6	793678	793683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_019439	GTT	2	6	794630	794635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019439	TAA	2	6	795591	795596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_019439	TTGAG	2	10	795605	795614	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_019439	CTT	2	6	795633	795638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_019439	TAA	2	6	795652	795657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_019439	TTGAG	2	10	795666	795675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_019439	CTT	2	6	795694	795699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_019439	TAT	2	6	795712	795717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_019439	GAG	2	6	795771	795776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_019439	A	6	6	795777	795782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_019439	AATT	2	8	795805	795812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_019439	GAT	2	6	795821	795826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_019439	AGT	2	6	796611	796616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_019439	TTA	2	6	796628	796633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_019439	TA	3	6	796743	796748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_019439	TA	3	6	796784	796789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_019439	TCC	2	6	796796	796801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3590	NC_019439	ACT	2	6	797827	797832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3592	NC_019439	AATA	2	8	798728	798735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_019439	A	7	7	798754	798760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_019439	TTTGG	2	10	798762	798771	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_019439	GAA	2	6	798789	798794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_019439	ATC	2	6	798800	798805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_019439	AAGA	2	8	799599	799606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_019439	GAA	2	6	799609	799614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_019439	GAA	2	6	799616	799621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_019439	T	6	6	799631	799636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_019439	T	8	8	800817	800824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_019439	AGT	2	6	800842	800847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_019439	TGA	2	6	802328	802333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_019439	A	6	6	802338	802343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_019439	TTTTG	2	10	802405	802414	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_019439	TTG	2	6	802430	802435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_019439	ATT	2	6	802470	802475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_019439	TAT	2	6	802482	802487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_019439	TAG	2	6	802551	802556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_019439	AAG	2	6	802580	802585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_019439	TAA	2	6	802662	802667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_019439	TCCC	2	8	802725	802732	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3614	NC_019439	GTG	2	6	802743	802748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_019439	ATTT	2	8	803618	803625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_019439	ATT	2	6	803637	803642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_019439	T	6	6	803650	803655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_019439	AAAT	2	8	803702	803709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_019439	ATTA	2	8	803747	803754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_019439	AT	3	6	803782	803787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_019439	ACT	2	6	803789	803794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_019439	ATA	2	6	803802	803807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_019439	AAAT	2	8	803840	803847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_019439	A	7	7	803857	803863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_019439	GAA	2	6	803898	803903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_019439	GTT	2	6	803927	803932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_019439	T	7	7	804007	804013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_019439	CAA	3	9	804023	804031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_019439	TCAT	2	8	804034	804041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_019439	TCA	2	6	804059	804064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_019439	ATT	2	6	804097	804102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_019439	ATT	2	6	804144	804149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_019439	CAC	2	6	804164	804169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_019439	AGG	2	6	804175	804180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_019439	TCA	2	6	804229	804234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3636	NC_019439	C	6	6	804304	804309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.